Tutti i documenti inventariati nella sezione Organizzazione parlano dei rapporti tra l'ufficio centrale e le istanze territoriali del partito; è infatti compito precipuo della Sezione di organizzazione la razionalizzazione, il controllo e il potenziamento della rete delle strutture del partito sul territorio. L'intitolazione di una serie ai Rapporti con le strutture territoriali risponde peraltro alla presenza di fascicoli originali intitolati a singole strutture non riconducibili a specifici momenti della vita del partito a livello centrale, come i congressi nazionali, né ad attività precisamente strutturate, con un iter definito, come sono quelle svolte annualmente per il tesseramento: ed è proprio in questa serie che si trovano, intrecciate tra loro, tutte le attività svolte dalla Sezione centrale di Organizzazione.
La serie conserva documentazione dei congressi provinciali, in quanto momenti importanti nella vita delle federazioni, fascicoli di riunioni con i segretari regionali e di federazione o con i responsabili territoriali dell'organizzazione; documenti di lavoro di responsabili nazionali, molti dei quali legati a situazioni controverse che inevitabilmente includono le operazioni di tesseramento; i fascicoli delle federazioni e dei comitati regionali, che conservano corrispondenze tra il centro e la periferia su tutti i momenti della vita delle strutture periferiche, da manifestazioni e eventi organizzati nel territorio di riferimento, ai congressi territoriali e dunque alla scelta degli organi direttivi, al tesseramento; alcuni fascicoli che testimoniano l'attività svolta dall'Organizzazione in relazione alle campagne elettorali, prima dell'istituzione di un Ufficio elettorale dedicato; infine documentazione relativa agli abbonamenti all'«Avanti!».